从0入门,掌握CUT&RUN技术成功指南
与染色质免疫沉淀 (ChIP) 检测一样,核酸酶靶向切割和释放 (CUT&RUN) 是一项用于在细胞天然染色质环境下检测蛋白-DNA相互作用的强大通用技术(1-4)。CUT&RUN技术检测范围更广,且提供了一种更快速、更可靠、真正的低细胞数测定法,可在一天之内完成从活细胞到纯化 DNA 的过程,且经证明每次检测只需使用少至 500-1000 个细胞 (1,2)。 那么,CUT&RUN原理和步骤是什么?它与其他DNA-蛋白质互作研究方案相比有哪些优点?它又是如何利用染色质抗体靶向消化方法使背景信号更低的呢?在设计实验时需要考虑什么确保实验结果真实可靠?该讲座将从0开始,带你领略CUT&RUN的魅力!赶快学习收藏吧! 活动报名和参与直播人数众多,在现场我们收到老师和同学的许多问题,也许您也有此疑问,所以罗列如下(按提问顺序排列): “CUT&Tag 和 CUT&RUN 这两个技术,可以用于研究像HBV病毒这种小的环状DNA的转录因子结合情况么?” 目前我们还没有看到用CUT&RUN 或者CUT&Tag类实验针对病毒材料样本做研究的。一个可能原因是CUT&RUN 或者CUT&Tag需要在细胞核结构内利用酶对比较大的动植物gDNA进行剪切,释放小片段进行检测。CUT&RUN是剪切之后gDNA被剪切的片段同蛋白复合物进行释放。CUT&Tag是剪切之后,进行tagmentation操作后再进行释放。 陈芳 博士 CST Senior Development Scientist 博后: 耶鲁大学 参考文献 1.Skene, P.J. and Henikoff, S. (2017) Elife 6, pii: e21856. doi: 10.7554/eLife.21856. 2.Skene, P.J. et al. (2018) Nat Protoc 13, 1006-19. 3.Meers, M.P. et al. (2019) Elife 8, pii: e46314. doi: 10.7554/eLife.46314. 4.Meers, M.P. et al. (2019) Mol Cell 75, 562-575.e5.
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